臺灣作物品項多元各具特色,國內推動生技產業發展,農業部早年即參與國科會農業生物技術國家型科技計畫,開發山苦瓜等作物的機能性功效,近年持續透過農糧科技計畫、「建構高值化農產素材開發與產業鏈結服務」等,推動作物生技利用相關研發,挖掘作物降血脂、改善脂肪肝、抑制癌細胞等醫療、保健用途,讓農產業加值,更發揮農業促進國人健康的效益。
國內推動進口替代作物大豆、黑豆栽培,養鹿產業生產鹿茸,透過其機能性成分,研發雞精、蛋白飲、益生菌等生技產品,擴展農畜產品多元應用,提高農畜產品價值。生技研發更讓屬於小眾市場的原生香檬、山苦瓜及臺灣特有種臺灣藜,找到新商機,得以開拓藍海市場,有機會把產業做大;甚至因生技技術的成熟,國內透過育種等研發,讓歐美暢銷保健作物紫錐菊,在臺灣從無到有建立農產業。近十年來農業部輔導農產品開發生物技術的案例愈趨規模。